大家好，欢迎查看《时空日报》第2期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计6篇。以下是应用华大时空StereoCopilot生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。

1：植入后人类干细胞谱系的自我更新和分化

Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages

Nature; IF: ; DOI: /s41586-023-06354-4

(资料图片仅供参考)

内容概要：人类多能干细胞能够被诱导自我分化形成三维结构，再现了人类早期（从Carnegie阶段4到阶段7）胚胎发育的关键时空事件，并为理解人类发育的基本细胞和分子机制提供了可重复、可操作和可扩展的实验平台。

2：全造血RNA条形码可实现有核和无核谱系的动力学测量和急性血小板耗竭后骨髓克隆的激活

Panhematopoietic RNA barcoding enables kinetic measurements of nucleate and anucleate lineages and the activation of myeloid clones following acute platelet depletion

Genome Biology; IF: ; DOI: /s13059-023-02976-z

内容概要：介绍了一种新的RNA条形码技术，该技术使用小鼠造血干细胞的慢病毒基因标记来量化所有谱系、有核细胞和无核细胞的输出，同时使用scRNA-seq将它们与干细胞和祖细胞转录组表型联系起来，以实现对外周血中的多谱系输出和单个造血干细胞转录异质性的动力学研究，为血小板耗竭后造血干细胞的重新激活，以及稳态和应激下的克隆动态提供了独特见解。

3.年龄相关B细胞预测接受免疫检查点阻断的患者接种COVID-19疫苗后体液免疫受损

Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade

Nature Communications; IF: ; DOI: /s41467-023-38810-0

内容概要：应用scRNA-seq研究不同免疫系统疾病患者（包括接受免疫检查点阻断治疗的癌症患者和先天性免疫缺陷患者）中的年龄相关B细胞（age-associated B cells，ABC）是否相似，以及它们如何影响COVID-19疫苗反应水平，确认了ABC扩增可以作为识别个体对疫苗接种反应不理想的风险生物标志物。

揭示PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用

Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B

Hepatology (Baltimore, Md.); IF: ; DOI:

内容概要：使用scRNA-seq绘制在PegIFN-α治疗前后慢性乙型肝炎（chronic hepatitis B，CHB）患者外周免疫细胞的转录组图谱，拓展了对CHB病理特征和PegIFN-α免疫调节作用的理解，为CHB的临床诊断和治疗提供了新见解。

5.人类疾病中淋巴组织基质细胞的新型低温保存和生物库策略

A novel cryopreservation and biobanking strategy to study lymphoid tissue stromal cells in human disease

European Journal of Immunology; IF: ; DOI:

内容概要：介绍了一种新的低温保存和生物库策略，用于研究人类疾病中的淋巴组织基质细胞。通过对人类扁桃体和淋巴结进行低温保存，并结合流式细胞术、scRNA-seq和原位分析，发现低温保存对细胞类型和转录谱的影响很小，提示这种广泛适用的方法有望极大地促进淋巴组织基质细胞在人类疾病中作用的研究。

6.单细胞蛋白质组学检测揭示相互作用蛋白质功能协调的相关蛋白质模块

Correlated protein modules revealing functional coordination of interacting proteins are detected by single-cell proteomics

The Journal of Physical Chemistry. B; IF: ; DOI: .3c00014

内容概要：应用单细胞蛋白质组学测量单个哺乳动物细胞中一对蛋白质转录水平之间的相关性，发现了多个相关蛋白模块（correlated protein modules，CPMs），每个模块都包含一组高度正相关的蛋白质，这些蛋白质在某些生物功能中具有功能相互作用并共同参与某些功能，如蛋白质合成和氧化磷酸化。与单细胞转录组学相比，单细胞蛋白质组学检测到的蛋白质之间的相关性更加明显，且功能更相关。

《时空日报》是华大时空基于时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot功能板块，推出的聚焦于时空组学领域学术前沿的栏目。以实时、精准追踪时空组学前沿为目标，共享最新时空知识，助力生命科学和临床医学发展。

标签：